Pracownia Diagnostyki Mikrobiologicznej

Kierownik Pracowni: dr n. biol. Katarzyna Semczuk

Lokalizacja: budynek A, piętro I

Sekretariat tel: +48 22 815 72 70

Sekretariat fax: +48 22 815 72 75

Pracownia tel: +48 22 815 72 68 (lub 72-69 lub 72-72 lub 72-66)

Adres e-mail: diagnostyka.mikrobiologia@ipczd.pl

Profil działalności:

Pracownia Diagnostyki Mikrobiologicznej zajmuje się diagnostyką zakażeń bakteryjnych, grzybiczych oraz wybranych zakażeń wirusowych. Badania wykonywane są z zastosowaniem metod klasycznych, takich jak bakterioskopia oraz hodowla drobnoustrojów na podłożach stałych i płynnych, prowadzona w warunkach tlenowych, mikroaerofilnych i beztlenowych. W Pracowni wykonywana jest również hodowla chorobotwórczych grzybów drożdżopodobnych i pleśniowych.

Zakres działalności Pracowni obejmuje w szczególności:

diagnostykę zakażeń inwazyjnych, w tym zakażeń krwi, z wykorzystaniem automatycznego systemu BD BACTEC (Becton Dickinson);
diagnostykę zakażeń ośrodkowego układu nerwowego, w tym posiewy płynu mózgowo-rdzeniowego oraz ocenę preparatów barwionych metodą Grama;
diagnostykę zakażeń układu oddechowego na podstawie materiałów pobieranych z górnych i dolnych dróg oddechowych, takich jak: wymazy z gardła, aspiraty z zatok, płyny i wymazy z ucha, plwocina, popłuczyny z drzewa oskrzelowego, aspiraty tchawicze oraz płyny z opłucnej;
diagnostykę zakażeń skóry i tkanek miękkich, w tym zakażeń miejsca operowanego, na podstawie materiałów z ran różnego pochodzenia, materiałów śródoperacyjnych, wycinków, bioptatów oraz treści z drenaży;
diagnostykę zakażeń związanych z obecnością cewników naczyniowych i innych biomateriałów;
diagnostykę zakażeń układu moczowego;
diagnostykę zakażeń przewodu pokarmowego o etiologii wirusowej, opartą na wykrywaniu antygenów wirusowych w kale (Rota/Adeno, Noro), oraz o etiologii bakteryjnej, opartą na hodowli drobnoustrojów, w tym m.in. Salmonella, Shigella, Yersinia spp., enteropatogennych E. coli oraz Campylobacter spp.;
diagnostykę zakażeń Clostridioides difficile (CDI), opartą na wykrywaniu w kale antygenu GDH oraz toksyn A i B, a także na hodowli C. difficile;
diagnostykę zakażeń Helicobacter pylori, opartą na hodowli z bioptatów błony śluzowej żołądka wraz z oznaczaniem lekowrażliwości;
diagnostykę nosicielstwa drobnoustrojów lekoopornych, tzw. patogenów alarmowych, takich jak: MRSA (Staphylococcus aureus oporny na metycylinę), VRE (Enterococcus faecalis / Enterococcus faecium oporne na glikopeptydy), ESBL (pałeczki Gram-ujemne wytwarzające β-laktamazy o rozszerzonym spektrum) oraz CPO (pałeczki Gram-ujemne oporne na karbapenemy, w tym KPC, MBL i OXA-48).

W Pracowni Diagnostyki Mikrobiologicznej wykonywane są również:

badania wymazów środowiskowych
kontrole jałowości płynów infuzyjnych i mieszanin do żywienia pozajelitowego;
kontrole jałowości sporali; (Instrukcja i zlecenie - pliki do pobrania)
badania jałowości homograftów.

Pracownia wykorzystuje zarówno klasyczne metody hodowlane i mikroskopowe, jak i nowoczesne technologie diagnostyczne, w tym automatyczne systemy monitorowania wzrostu drobnoustrojów, spektrometrię masową MALDI-TOF MS, zautomatyzowane systemy oznaczania lekowrażliwości oraz wybrane metody molekularne. Umożliwia to uzyskiwanie wiarygodnych wyników, istotnych dla szybkiego rozpoznania zakażenia, wdrożenia właściwego leczenia oraz optymalizacji terapii przeciwdrobnoustrojowej. Istotnym elementem działalności Pracowni jest także wspieranie nadzoru nad zakażeniami szpitalnymi oraz monitorowanie zjawiska lekooporności drobnoustrojów.

Wysoką jakość wykonywanych badań potwierdza udział Pracowni w programach zewnętrznej oceny jakości, w tym Polmicro, Labquality oraz UK NEQAS, obejmujących m.in. identyfikację drobnoustrojów, oznaczanie lekowrażliwości oraz wykrywanie mechanizmów oporności.

Pracownia uczestniczy również w badaniach naukowych i klinicznych oraz prowadzi ocenę i wdrażanie nowych metod i innowacyjnych technologii w diagnostyce mikrobiologicznej.

Lista badań wykonywanych w Pracowni Diagnostyki Mikrobiologicznej - plik

Definicje i słownik skrótów stosowanych w wynikach mikrobiologicznych - plik

Linki do tabel z rekomendacjami:

https://eucast.org/clinical_breakpoints

http://korld.nil.gov.pl

Wszystkich chętnych do współpracy w ramach prowadzonych badań diagnostycznych

i współpracy naukowej serdecznie zapraszamy.

Tel: +48 22 815 72 68

Adres e-mail: diagnostyka.mikrobiologia@ipczd.pl

Badania komercyjne

W Pracowni Diagnostyki Mikrobiologicznej istnieje możliwość odpłatnego wykonania badań mikrobiologicznych dla kontrahentów zewnętrznych.

Szczególną pozycję w ofercie stanowi specjalistyczne badanie: posiew bioptatu (wycinka) błony śluzowej żołądka w kierunku Helicobacter pylori. Badanie obejmuje hodowlę drobnoustroju oraz wykonanie antybiogramu po uzyskaniu wzrostu. Informacja na temat badania posiew w kierunku Helicobacter.

Zleceniodawcy kierujący materiał do badania w kierunku Helicobacter pylori proszeni są o zapoznanie się z informacją dotyczącą badania oraz o dostarczenie, wraz z pobranym materiałem, prawidłowo wypełnionego zlecenia:

Informacje o pacjencie wykonującym badanie wycinka w kierunku Helicobacter.

Ze względu na specjalistyczny charakter badania przed dostarczeniem materiału konieczny jest wcześniejszy kontakt telefoniczny z Pracownią Diagnostyki Mikrobiologicznej pod numerami: 22 815 72 72 lub 22 815 72 69.

Materiał do badań przyjmowany jest od poniedziałku do piątku w godzinach 8:00–15:00 w Rejestracji Zakładu Mikrobiologii i Immunologii Klinicznej, budynek A, I piętro.

Wykaz badań komercyjnych wykonywanych w Pracowni Diagnostyki Mikrobiologicznej:

posiew wymazu z gardła w kierunku paciorkowców chorobotwórczych;
ilościowy posiew moczu w kierunku bakterii tlenowych;
posiew materiału w kierunku bakterii tlenowych, np. plwociny, wymazu z rany, ropnia, spojówki oka, treści z zatok przynosowych, wymazu z pochwy;
posiew materiału w kierunku bakterii beztlenowych, np. materiału z rany lub ropnia;
posiew materiału w kierunku grzybów;
badanie kału metodą posiewu w kierunku bakteryjnych czynników etiologicznych biegunki, w tym Salmonella, Shigella, Campylobacter, Yersinia oraz biegunkotwórczych Escherichia coli (EPEC/EHEC);
badanie kału w kierunku Clostridioides difficile (wykrywanie antygenu GDH oraz toksyn);
badanie kału w kierunku wirusów biegunkowych (wykrywanie antygenów rotawirusów, adenowirusów i norowirusów);
badanie w kierunku kolonizacji szczepami lekoopornymi na podstawie wymazu z nosa, gardła lub odbytu, w tym w kierunku MRSA/MSSA, VRE, ESBL i CPE;
posiew bioptatu (wycinka) błony śluzowej żołądka w kierunku Helicobacter pylori;
badanie jałowości sporali (Instrukcja i zlecenie - pliki do pobrania)

Aktualne ceny oraz wskazówki dotyczące sposobu opłaty za badania i odbioru wyników znajdują się na stronie Instytutu w wyszukiwarce badań płatnych: link

OGÓLNE ZASADY DOTYCZĄCE POBIERANIA MATERIAŁÓW DO BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH WYKONYWANYCH KOMERCYJNIE:

Materiał do badań mikrobiologicznych powinien być pobrany przed rozpoczęciem leczenia antybiotykowego, najlepiej po konsultacji z lekarzem;
W przypadku braku poprawy po leczeniu antybiotykowym materiał należy pobierać minimum 3- 4 dni po ostatniej dawce antybiotyku;
Przed pobraniem materiału należy zapoznać się z uwagami dotyczącymi pobierania, transportu, przechowywania materiału, a w przypadku wątpliwości skonsultować się z diagnostą laboratoryjnym, mikrobiologiem (Pracownia Diagnostyki Mikrobiologicznej tel. 22 815 72 69 lub 22 815 72 72);
Pobrany materiał należy dokładnie opisać danymi pacjenta (imię i nazwisko, PESEL, data i godzina pobrania materiału);
Do każdego materiału należy wypełnić formularz zlecenia na badanie: formularz

Instrukcje oraz formularze zleceń dla wybranych badań dostępne są w plikach do pobrania.

Instrukcje pobrania materiału – pliki do ściągnięcia:

Instrukcja pobierania moczu na posiew

Instrukcja pobierania próbki kału lub wymazu z odbytu w diagnostyce biegunek

Instrukcja pobierania wymazu z gardła

Instrukcja Pobierania wymazu z nosa lub wymazu z odbytu

Instrukcja pobierania plwociny

Instrukcja pobierania wymazu z ucha zewnętrznego

Instrukcja pobierania wymazu z oka

Instrukcja dostarczania sporali

Ulotki dla pacjentów i rodziców - pliki do pobrania:

Jak pobierać mocz?